A principal fonte de captação de dentes para o BDH-UFPR são as clínicas do curso de Odontologia da Universidade Federal do Paraná. Todos os pacientes submetidos a exodontias são informados sobre a possibilidade de doarem seus órgãos dentários e assim contribuir para a formação de novos profissionais dentistas, bem como para avanços científicos oriundos de pesquisas realizadas com os órgãos doados.
Os pacientes que concordarem com a doação devem preencher o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (TCLE) que é fornecido pelo responsável do atendimento. Os dentes doados oriundos das Clínicas da UFPR podem ser classificados como Dentes Rastreáveis, ou seja, é possível o rastreio das informações contidas no prontuário do paciente e relacioná-las aos órgãos doados. Dessa forma, os dentes rastreáveis são reservados para pesquisas científicas que possam vir a correlacionar dados de saúde dos pacientes com suas manifestações dentárias.